Shiba nel test genetico: loci colorati

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Scritto originariamente in finlandese per Shibasanomat 2/2020. La versione inglese gentilmente tradotta da Topi Kuusinen.

Questa parte della serie di test genetici discute i colori del mantello. Il database pubblico dei cani di MyDogDNA è un buon posto per studiare la genetica dei colori degli Shibas, perché i dati di solito includono, oltre ai risultati del test, una foto del cane e il nome ufficiale. Attualmente il database include 51 Shiba con dati pubblici.

Luogo	Proprietà	Colorazione
E	Rosso recessivo	Colorato o crema
Un	Aguti	Rosso, sesamo o nero con abbronzatura
S	Macchia bianca	Completamente colorato o marcato pinto

I test del colore inclusi nel pannello di test MyDogDNA. La variazione dei loci all'interno della razza, quindi spiegano i diversi colori di base degli Shiba.

Alcuni dei termini comunemente usati con Shiba sono diversi da quelli nel pannello, ad esempio lo zibellino genetico è lo stesso di uno Shiba rosso. Tutti gli Shiba hanno le stesse forme geniche, cioè alleli per un certo numero di loci di colore, per cui si dice che questi alleli si siano fissati nella razza. Attualmente, ci sono tre loci che descrivono i cambiamenti del colore del mantello in Shiba (loci è plurale per locus, e locus significa l'indirizzo di un gene o altra sequenza di DNA nel cromosoma) che sono stati verificati: un locus, E locus e il locus S per la macchia bianca.
Si noti che i test genetici non "leggono" l'intero gene. Sono progettati per rilevare solo determinate mutazioni. Altre mutazioni possono essere presenti nel gene, ma i test genetici non sanno cercarle. Spesso non è chiaro se la mutazione rilevata causi il tratto associato, o se si tratti solo di una mutazione marcatrice casuale ereditata insieme alla mutazione causale effettiva.

A-locus e colore di base del mantello   

Il locus A, cioè agouti, dà uno Shiba al rosso, al nero e all'abbronzatura o al sesamo di colore base. Una crema Shiba è anche uno di questi tre per quanto riguarda il luogo A, anche se con la crema il colore del locus A non può essere espresso.
Attualmente si ritiene che almeno tre alleli siano possibili per il locus A in Shibas, i nomi ufficiali degli alleli differiscono un po 'da quelli comunemente usati. Allele Ay è collegato alla colorazione dello zibellino, ma in Shibas questo significa colore rosso. Allele at, cioè punti di abbronzatura, è noto come nero e marrone chiaro in Shibas. L'allele del colore del mantello aw, che si trova nei lupi e chiamato sia agouti che grigio lupo, è collegato al colore del sesamo agouti in Shibas. Un quarto allele potrebbe essere l'ipotetico Ays, che potrebbe spiegare il colore rosso sesamo.
Il risultato del test genetico mostra il tipo di gene ereditato sia dalla madre che dal padre. In uno Shiba rosso, almeno uno di questi è sempre Ay. Per i sesamo aw le possibilità sono aw/aw o aw/at. Uno Shiba nero e marrone ha ereditato l'allele at da entrambi i genitori, quindi il suo genotipo è at/at. In pratica, il risultato del test per A locus è interessante quando si vuole sapere se uno Shiba rosso porta il colore B&T o sesamo, perché entrambi sono recessivi sotto la colorazione del mantello rosso. Il riconoscimento visivo di un portatore di sesamo (Ay/aw) può essere impossibile. Portare un colore ha un effetto sui possibili colori dei cuccioli prodotti dal cane.
Curiosità: Nella maggior parte dei laboratori di prova l'allele aw del locus A è definito per eliminazione. Se gli altri tre alleli (Ay, at e a) non corrispondono, il risultato viene interpretato come allele aw. In linea di principio questo metodo può produrre uno strano risultato del test, se il genotipo del cane è molto insolito.

E-locus e crema

Il locus E in cima all'elenco è correlato al fatto che il colore di base del locus A possa essere espresso. Questo è chiamato epistasia, l'effetto di un gene su un altro gene. In uno Shiba le opzioni sono "E maiuscola", cioè colorata, o "piccola e", che si esprime come crema. Se uno Shiba ha ereditato la "E maiuscola" da almeno uno dei suoi genitori, esprimerà il colore di un locus. Uno Shiba con il genotipo E/e ha ereditato l'espressione del colore da uno dei suoi genitori e l'allele crema dall'altro genitore. In altre parole, un tale Shiba porta la crema. I portatori di crema possono spesso essere facilmente distinguibili dal loro urajiro più grande e luminoso.
Una crema Shiba può nascere da una combinazione di due portatori di crema se il cucciolo eredita la "piccola e" da entrambi i genitori. In questo caso il colore di A locus non può essere espresso. Uno Shiba con genotipo e/e è geneticamente un "rosso recessivo" e un "rosso diluito", perché in realtà la crema (bianca) di una crema Shiba è un pigmento rosso dal tono molto chiaro.
I termini rosso recessivo e rosso diluito sono in questo contesto solo legati al pigmento rosso controllato dal locus E. Per quanto riguarda A locus, una crema Shiba può essere una delle tre: rosso, B&T o sesamo. La presenza dell'allele crema negli Shiba testati da MyDogDNA (inclusi sia i portatori che i cani color crema) è quasi del 25%.
Sembra molto probabile che il pool genetico di Shiba manchi degli alleli del locus E che causano la maschera nera (Em), la colorazione del domino del levriero (Eg) e l'antica colorazione rossa (eA). Tuttavia, nuovi e nascosti alleli del locus E - attualmente non rilevati da alcun test genetico - possono ancora apparire.

S-locus e il pinto Shiba

In un embrione in via di sviluppo le cellule del pigmento migrano dalla parte superiore della testa e indietro verso le estremità. Se la migrazione di queste cellule viene intercettata per qualsiasi motivo, la pelle del cane avrà aree senza pigmento. Il colore dell'area non pigmentata è bianco brillante con bordi nitidi in contrasto con l'urajiro, dove la tonalità del pigmento rosso è quasi biancastra. Indipendentemente dai geni, piccoli segni bianchi possono formarsi sul petto, sulle dita dei piedi o sulla fine della coda, e questo è chiamato bianco residuo.
A Shibas, grandi segni bianchi al di fuori dell'area urajiro sono solitamente collegati a macchie bianche genetiche, cioè il locus S. L'allele "normale" per il locus S è S, ma Shibas può anche avere l'allele sp, chiamato pezzato. Questa forma genetica interferisce con la diffusione delle cellule del pigmento.
Uno Shiba di genotipo sp/sp può avere calze bianche lunghe fino al gomito, una macchia nel collo o nel corpo o anche un motivo che ricorda quello di un Akita americano. In uno Shiba, i segni bianchi eccessivi sono chiamati colorazione pinto, e secondo lo standard di razza è un difetto squalificante.
Un supporto di colorazione pinto (S/sp) non presenta necessariamente segni bianchi. Calze bianche lunghe fino alla caviglia, una striscia sul muso o un punto nascosto nell'urajiro sul petto possono, tuttavia, indicare un portatore di pinto. Ciò significa che la colorazione pinto bianca (=pigmento mancante) relativa al locus S è diversa dalla crema Shiba relativa al locus E (=tonalità molto chiara del pigmento). Uno Shiba crema può anche avere il colore pinto o portare il gene pinto, anche se le aree pinto-bianche non possono essere viste nel colore chiaro del mantello di uno Shiba crema.

Come tutti gli altri tratti recessivi, un cucciolo di pinto è possibile solo se entrambi i genitori portano la colorazione pinto. Oltre al problema estetico, la colorazione pinto bianca può causare problemi di salute, perché sulla testa può portare alla sordità innata del cane. La presenza dell'allele sp che causa pinto è attualmente di circa il 7% negli Shiba testati da MyDogDNA.
I calzini bianchi e la macchia bianca sul retro di Shiba mostrati nella foto sono forti indicatori di macchie bianche o portamento. Nonostante ciò, il test genetico non ha rilevato alcun allele noto per la macchia bianca nel locus S (il risultato del test è l'S / S di colorazione completa). Tuttavia, qualcosa ha influenzato la pigmentazione in fase embrionale.
È probabile che il locus S e la macchia bianca non sempre "funzionino" negli Shiba e in altre razze indigene giapponesi come previsto. In alcuni casi, uno Shiba con evidenti calze bianche e lunghe è secondo il test genetico un S / S non macchiato bianco, e uno Shikoku o Akita completamente colorati può avere la forma genetica di sp / sp.

Qualche informazione in più su diversi sesamo Shiba

Ci sono almeno due diverse basi genetiche per il colore del sesamo di Shibas. Il tipo ben noto di colore del sesamo è il sesamo aw rilevato dal test genetico. In questa forma la colorazione è causata dall'allele aw del locus A. In questo tipo di sesamo, la punta nera del mantello si esprime sulle stesse aree di un B&T Shiba, estendendosi fino alla sommità del muso e vicino alle caviglie sulla parte anteriore delle zampe anteriori. La tonalità di un sesamo aw può variare da una tonalità rossastra e brunastra a una tonalità molto scura, che di solito sono chiamati sesamo nero.

Un tipo di sesamo meno noto è probabilmente basato sulla forma del gene Ays (sesamo Ay), che fa sì che il rosso sia ombreggiato dal nero. Gli attuali test genetici non sono in grado di rilevare Ays - il risultato è sempre rosso Ay. In questo caso l'ombreggiatura nera copre totalmente la schiena e la testa del cane, ma non si estende fino alle zampe o alla parte superiore del muso. Sulla fronte di solito c'è un acuto "picco della vedova" che punta verso il muso. La tonalità può essere bruno rossastra, grigio rossastro o anche leggermente giallastro. Tale sesamo è stato chiamato sesamo rosso (anche se un sesamo aw può anche sembrare rossastro), sesamo di picco della vedova (anche se questo modello non è necessariamente visibile) e sesamo Ay/at (anche se la colorazione sembra essere possibile anche per uno Shiba avente il genotipo Ay/aw). Quindi il nome migliore per questo colore potrebbe forse essere sesamo zibellino o sesamo di Ays.

Ci sono regolarmente nuove, interessanti osservazioni delle caratteristiche del sesamo Shiba sul gruppo pubblico di sesamo Shiba di Facebook.

Quindi qual è il "vero" sesamo?

La risposta è molto semplice: entrambi i tipi di sesamo sono altrettanto veri sesamo purché lo Shiba assomigli a uno Shiba di sesamo corretto. Lo standard di razza per lo Shiba, o il piccolo cane giapponese, è stato scritto in Giappone quasi 100 anni fa. La colorazione del sesamo non è mai stata definita da test genetici o genotipi, ma piuttosto da come i colori del mantello apparivano agli occhi. L'equilibrio - non troppo e non troppo poco - era probabilmente di nuovo la chiave, e la colorazione ideale del sesamo non dovrebbe essere troppo scura né troppo chiara.
Se siamo precisi, un sesamo Shiba non può mai essere "un sesamo genetico" in quanto tale termine non esiste nella genetica del colore del mantello del cane. Il sesamo di tipo Ays corrisponde probabilmente a uno zibellino sfumato genetico, mentre il sesamo aw si riferisce a un agouti genetico.

Sesamo di zibellino o sashige?

Oltre a un sesamo Ays, uno Shiba con il risultato del test genetico E/E Ay/at può essere rosso vivo o sfumato con nero solo sul collo e sul dorso; in giapponese "sashige", rosso sporco. Anche un rosso "che porta rosso" (genotipo Ay / Ay) a volte ha un po 'di nero sul dorso o sulla coda. C'è una regola empirica per discernere tra un sashige e un sesamo di zibellino. Se devi pensarci, la colorazione è sashige, non sesamo zibellino. La differenza è più evidente se vista frontalmente. Le probabilità sono anche sul lato di un sashige, poiché i sesamo di zibellino sono molto rari.