В оригинале написано на финском языке для журнала Shibasanomat 2/2020.

   В этой части серии генных тестов обсуждаются цвета шерсти. Публичная база данных собак MyDogDNA является хорошим местом для изучения генетики окрасов сиба-ину, поскольку данные обычно включают, помимо результатов тестирования, фотографию собаки, а также официальное имя. В настоящее время база данных включает 51 сиба-ину с публичными данными.

Тесты окраса, включенные в панель тестов MyDogDNA. Локусы содержат вариации внутри породы, поэтому они объясняют различные основные окрасы сиба-ину. 

   Некоторые термины, обычно используемые в отношении сиба-ину, отличаются от тех, что приведены в таблице, например, генетический соболь - это то же самое, что и рыжая сиба-ину. Все сибы имеют одинаковые генные формы, т.е. аллели для ряда локусов окраса, поэтому считается, что эти аллели закрепились в породе. В настоящее время существует три локуса, описывающих изменения окраса шерсти у сиб (локусы - это множественное число от слова locus, а locus означает адрес гена или другой последовательности ДНК в хромосоме), которые были проверены: A-локус, E-локус и S-локус для белой пятнистости.

А-локус и основной окрас шерсти   

   Локус окраса А, т.е. агути, дает сибе либо рыжий, либо черно-подпалый, либо кунжутный основной окрас. Кремовый также является одним из трех окрасов локуса А, хотя у кремового окраса локус А не может быть выражен.

   В настоящее время считается, что для локуса А у сибы возможны по крайней мере три аллеля, причем официальные названия аллелей несколько отличаются от общепринятых. Аллель Ay связана с соболиным окрасом, но у сиб это означает рыжий цвет. Аллель at, т.е. подпалый, у сиб известен как черно-подпалая. Аллель aw, встречающийся у волков и называемая как Агути, так и волчье-серый, связан с кунжутным окрасом агути у сиба-ину. Четвертым аллелем может быть гипотетическая Ays, который может объяснить окрас красный сезам.

   Результат генного теста показывает генный тип, унаследованный как от матери, так и от отца. У рыжих сиб, по крайней мере, один из них всегда Ay. Для кунжута (сезама) aw возможны варианты aw/aw или aw/at. Черно-подпалая сиба наследует аллель at от обоих родителей, поэтому ее генотип - at/at. На практике результат теста по локусу A интересен, когда хотят узнать, несет ли сиба рыжий, черно-подпалый или кунжутный окрас. Черно-подпалый и сезам рецессивны при рыжем окрасе шерсти. Визуальное распознавание носителя кунжутного окраса (Ay/aw) может быть невозможным. Носительство окраса влияет на возможные окрасы щенков, производимых этой собакой.

   Интересный факт: В большинстве лабораторий аллель aw определяется методом исключения. Если три других аллеля (Ay, at и a) не совпадают, результат интерпретируется как аллель aw. В принципе, этот метод может дать странный результат теста, если генотип собаки очень необычен.

Е-локус и кремовый окрас

   Локус E связан с тем, может ли быть выражен базовый цвет локуса A. Это называется эпистазией, влиянием гена на другой ген. У сибы возможны следующие варианты: "заглавная Е", то есть окрашеная, или "маленькая e", которая выражается как кремовая. Если cиба унаследовала "заглавную Е" хотя бы от одного из своих родителей, она будет выражать окрас локуса А. Cиба с генотипом E/e наследует выражение окраса от одного из своих родителей и кремовую аллель от другого родителя. Другими словами, такая сиба является носителем кремового окраса. Носителей кремового окраса часто можно легко отличить по более крупному и яркому ураджиро.  

   Кремовая сиба может родиться от комбинации двух носителей кремового окраса, если щенок унаследовал "малый e" от обоих родителей. В этом случае окрас локуса A не может быть выражен. Сиба с генотипом e/e генетически является "рецессивным рыжим" и "разбавленным рыжим", потому что в действительности крем (белый) кремовой сибы - это рыжий пигмент с очень светлым оттенком.

   Термины "рецессивный" и "разбавленный рыжий" в данном контексте относятся только к рыжему пигменту, контролируемому локусом E. Что касается локуса A, то кремовая сиба может быть с любым из трех окрасов: рыжей, черно-подпалой или кунжутной. Встречаемость кремовой аллели у сиб, протестированных MyDogDNA (включая как носителей, так и собак кремового окраса), составляет почти 25%. 

   Наиболее вероятно, что в генофонде сиб отсутствуют аллели локуса E, вызывающие черную маску (Em), окрас домино борзой (Eg) и древний рыжий окрас (eA). Однако новые и скрытые аллели локуса E, которые в настоящее время не обнаруживаются никакими генными тестами, все еще могут появиться.

S-локус и пинто-сиба

   У развивающегося эмбриона пигментные клетки мигрируют с верхней части головы и обратно к конечностям. Если миграция этих клеток по какой-либо причине прерывается, на коже собаки появляются участки без пигмента. Цвет непигментированных участков ярко-белый с четкими границами в отличие от ураджиро, где оттенок рыжего пигмента почти не имеет белого цвета. Независимо от генов, небольшие белые отметины могут образовываться на груди, пальцах ног или конце хвоста, и это называется остаточной белизной. 

   У сибы большие белые отметины за пределами области ураджиро обычно связаны с генетической белой пятнистостью, т.е. с локусом S. Нормальной аллелью для локуса S является S, но у сибы может быть и аллель sp, называемый пегой. Эта форма гена мешает распространению пигментных клеток.

   У сибы с генотипом sp/sp могут быть белые носки длиной до локтя, пятна на шее или теле или даже рисунок, напоминающий рисунок американской акиты. У сиб чрезмерно белые отметины называются окрасом пинто, и в соответствии со стандартом породы это дисквалифицирующий недостаток.

   Носитель окраса пинто (S/sp) не обязательно имеет белые отметины. Однако белые носки длиной до щиколоток, полоска на морде или пятно, спрятанное в ураджиро на груди, могут указывать на носителя окраса пинто. Это означает, что белый окрас пинто (=отсутствие пигмента), связанный с локусом S, отличается от кремовой сибы, связанного с локусом E (=очень светлый оттенок пигмента). Кремовая сиба также может иметь окрас пинто или нести ген пинто, даже если пинто-белые участки не видны в светлом окрасе шерсти кремовой сибы.

   Как и все другие рецессивные признаки, щенок пинто возможен только в том случае, если оба родителя несут окрас пинто. Помимо эстетической проблемы, белый окрас пинто может вызвать проблемы со здоровьем, так как на голове он может привести к врожденной глухоте собаки. Встречаемость аллели sp, вызывающего окрас пинто, в настоящее время составляет около 7% среди сиб, протестированных MyDogDNA.

   Вполне вероятно, что локус S и белая пятнистость не всегда "функционируют" у сибы и других аборигенных японских пород так, как ожидается. В некоторых случаях сибы с очевидными белыми длинными носками, согласно генному тесту, являются не бело-пятнистым S/S, в то время как полностью окрашенные сикоку или акита могут иметь генетическую форму sp/sp.
   Белые носки и белое пятно на спине сиба-ину представленной на фото являются сильными индикаторами белой пятнистости или ее носительства. Несмотря на это, генный тест не выявил никаких известных аллелей для белой пятнистости в локусе S (результат теста - S/S полного окраса). Однако, что-то повлияло на пигментацию на эмбриональной стадии.

Еще немного информации о различных кунжутных Сибах

   Существует по крайней мере две различные генетические основы для кунжутного окраса сибы. Хорошо известный тип кунжутного окраса - это кунжут aw, выявляемый генным тестом. В этом виде окраска вызвана аллелью aw локуса A. При этом типе сезама черный отлив шерсти выражен на тех же участках, что и у черно-подпалой сибы, простираясь до верхней части морды и около лодыжек на передней части передних лап. Оттенок сезама может варьироваться от рыжеватого и коричневатого до очень темного оттенка, который обычно называют черным сезамом.

   Менее известный кунжутный тип, вероятно, основан на генной форме Ays (Ay sesame), из-за которой рыжий цвет оттеняется черным. Современные генные тесты не могут выявить Ays - результат всегда рыжий Ay. В этом случае черный цвет полностью покрывает спину и голову собаки, но не распространяется далеко вниз на ноги или верхнюю часть морды. На лбу обычно имеется острый "вдовий пик", направленный к морде. Оттенок может быть рыжевато-коричневым, рыжевато-серым или даже слегка желтоватым. Такой сезам называют красным сезамом (хотя сезам aw тоже может выглядеть красноватым), сезамом с вдовьим пиком (хотя этот рисунок не обязательно виден) и сезамом Ay/at (хотя этот окрас, похоже, возможен и у сиб с генотипом Ay/aw). Поэтому лучшим названием для этого окраса может быть соболиный сезам или Ays сезам.
   В других породах собак этот окрас обычно называют соболиным с оттенком. Генетическая причина до сих пор неизвестна, однако предполагалось, что существуют отдельные гены-модификаторы или эпигенетические модификации (= одна и та же последовательность ДНК, но разная активность экспрессии генов). Новые исследования обнаружили специфические модули регуляции генов в локусе A, которые, по-видимому, различаются между соболиными и затененными соболиными собаками. Пока неясно, действительно ли эта новая система локуса A обнаруживает гипотетический аллель Ays.
   Обычно черный оттенок соболиного сезама появляется у изначально рыжего щенка только после сбрасывания первой щенячьей шерсти. В генном тесте соболиные сезамы, похоже, имеют генотип E/E Ay/at или E/E/ Ay/aw, что означает, что они обычно не несут кремовый. Предполагается, что фенотип соболиного сезама наследуется с формой гена Ays, которая рецессивна к рыжему (Ay), но доминантна к aw сезаму и черно-подпалому (at). Из этого следует, что при разведении кунжутной Ays и черно-подпалой сиб должны получиться щенки либо кунжутного Ays, либо черно-подпалого окраса. Пока не совсем ясно, как выглядят носители кремового или "двойные Ays" сибы. Заводчики кунжутных сиб Ays сообщают, что гипотетическая форма гена Ays действительно наследуется предсказуемым образом.

   В публичной группе кунжутных сиб на Facebook регулярно появляются новые интересные наблюдения за характеристиками сезама. the public sesame Shiba group of Facebook.

Так какой же "настоящий" сезам?

   Ответ очень прост: оба типа сезама являются настоящими до тех пор, пока сиба выглядит как правильная кунжутная сиба. Стандарт породы сибы, или маленькой японской собаки, был написан в Японии почти 100 лет назад. Кунжутный окрас никогда не определялся генными тестами или генотипами, а скорее тем, как цвет шерсти выглядел на глаз. Баланс - не слишком много и не слишком мало, вероятно, был ключевым моментом, и идеальный кунжутный окрас не должен быть ни слишком темным, ни слишком светлым.
   Если быть точным, то кунжутная сиба никогда не может быть "генетическим сезамом", поскольку такого термина не существует в генетике окрасов шерсти собак. Тип Ays сезам, скорее всего, соответствует генетически затененному соболю, в то время как aw сезам относится к генетическому агути.

Соболиный сезам или сашиге?

   Помимо сезама Ays, сиба с результатом генного теста E/E Ay/at может быть ярко-рыжей или оттененной черным только на шее и спине - по-японски "сашиге", грязно-рыжий. Даже рыжий "несущий рыжий" (генотип Ay/Ay) иногда имеет немного черного на спине или хвосте. Существует эмпирическое правило, как отличить сашиге от соболиного сезама. Если задуматься, то это окрас сашиге, а не соболиного сезама. Разница наиболее очевидна при взгляде спереди. Шансы также на стороне сашиге, поскольку соболиный сезам встречается очень редко.

Смертельное наследственное заболевание сиба-ину

   В 2000 году в Японии у сиба-ину впервые было диагностировано редкое наследственное заболевание, которое было известно у разных пород, но до этого момента не встречалось у сиб. Речь идет о так называемом нарушении хранения (метаболическом заболевании) под названием ганглиозидоз GM1, которое не поддается лечению и приводит к летальному исходу в течение полутора лет.

  Болезнь была обнаружена группой ветеринарных врачей, работающих с доктором Осаму Ямато в Университете Хоккайдо в Саппоро. За короткое время эти ученые обнаружили причину этого заболевания у сиб (мутация гена) и с тех пор разработали новый метод диагностики. Они предполагают, что возможно, существует высокая распространенность носителей по всей Японии и поэтому необходимо принять профилактические меры против ганглиозидоза GM1 у собак породы сиба-ину, чтобы искоренить это заболевание или хотя бы снизить распространенность носителей. Исследователи также обеспокоены тем, что это новое заболевание уже могло попасть в Америку, Европу и Австралию.

  Что такое ганглиозидоз? 

   Ганглиозидоз относится к группе наследственных заболеваний, известных как "лизосомальные болезни хранения". Лизосомы - это особые структуры внутри клетки, в которых, как в "канализационной станции", происходит деградация или изменение многих веществ. Молекулы, осуществляющие это разрушение или изменение, называются ферментами. При лизосомальном нарушении хранения вещества, которые из-за дефицита ферментов не могут быть переработаны, хранятся в лизосомах. В случае ганглиозидоза ганглиозиды (жиро-сахарные соединения) накапливаются в клетках мозга. В результате жизненно важные функции клеток мозга нарушаются, что приводит к тяжелым симптомам болезни.

   Ганглиозидоз встречается в двух различных формах. Ганглиозидоз GM1 вызывается наследственным дефицитом фермента бета-галактозидазы. При этой форме неврологические симптомы начинаются немного позже (примерно в 4 месяца) и протекают медленнее. При ганглиозидозе GM2 отсутствует фермент бета-гексозаминидаза, картина заболевания обычно проявляется раньше и быстрее усугубляется. Несмотря на то, что обе формы ганглиозидоза имеют схожие симптомы, они вызываются совершенно разными дефектами двух специфических лизосомальных ферментов. Эти генетические дефекты, известные как мутации, обусловлены изменением генетического кода.

   Губительность обоих этих заболеваний заключается в том, что они наследуются скрыто (аутосомно-рецессивным путем). При такой передаче болезнь проявляется только тогда, когда обе формы критического гена дефектны (в отличие от аутосомно-доминантного наследования, когда болезнь проявляется при дефекте только одного критического гена). Наследственность ганглиозидоза следует классическим законам генетики. Индивидуум всегда наследует одну копию гена от матери и одну от отца. Рецессивное течение наследственности означает, что собаки, несущие только одну копию дефектного гена (т.е. гетерозиготные), клинически здоровы, но являются носителями. Сами носители никогда не заболеют этой болезнью, но существует 50% вероятность того, что они передадут дефектный ген своему потомству. Только при наличии двух копий дефектного гена (от матери и от отца), т.е. если щенок гомозиготный, болезнь проявится. При спаривании носителей 25% их потомства, по статистике, заболеют ганглиозидозом, 50% будут носителями и 25% будут свободны от дефектного гена.

   К сожалению, эффективного лечения этого заболевания не существует. Болезнь проявляется у совсем крошечных щенков, и никакой уход не приносит результатов - болезнь только прогрессирует, в итоге щенок перестает узнавать хозяина. Видеть, как на ваших глазах умирает любимая собака - огромный психологический шок для владельца. Все эти чувства выливаются в сильный гнев, владелец привлекает к ситуации регистрирующую организацию, а заводчик или зоомагазин сталкивается с серьезными проблемами.

Возраст (месяцы)	Клинические признаки
<5	Отсутствие клинических и неврологических признаков
5-6	Потеря равновесия, хромота (периодическая), атаксия (легкая или умеренная), дисметрия (в основном гиперметрия), тремор головы (тремор намерения)
7-8	Атаксия (тяжелая), шатающаяся походка, преувеличенно испуганная реакция
9-10	Атактическая абазия, астазия, помутнение роговицы, дефект зрения, ригоспастичность мышц конечностей и холки, эмоциональное расстройство
11-12	Генерализованная мышечная ригоспастика, тонический спазм, склонность к вялости, не реагирование на звуки, потеря веса
13<	Летаргия, смерть (в основном после 14 месяцев)

Профилактические меры.

Носители и этика обращения с животными.

   Собака, которая в результате генетической экспертизы была определена как носитель, имеет абсолютно здоровый организм и как домашнее животное ничем не отличается от обычных собак. Носителей лучше не использовать для разведения, однако (как отмечалось выше, есть много случаев, когда при определенных условиях такую собаку следует использовать для скрещивания с нормальной собакой), вы можете завести такую собаку в качестве домашнего любимца. Если вы случайно обнаружите, что ваш питомец является носителем, в этом нет ничего плохого. Но если вы приобрели носителя для дальнейшего разведения или если болезнь передается дальше, возникнет очень серьезная ситуация: такой заводчик потеряет доверие всей ассоциации. По мнению Осаму Ямото, некоторые владельцы не согласны с покупкой носителя в качестве домашнего питомца, и он особенно подчеркивает, что речь идет о некомпетентных собаководах, чьи собаки, скорее всего, не заслуживают внимания. На самом деле, не существует животных или людей с полным отсутствием каких-либо генетических заболеваний, у всех есть доля мутировавших генов. Если человек будет принимать искусственные меры против распространения носителей, то возникнет очень серьезная проблема с этической точки зрения, и есть вероятность, что в будущем такой питомник или организация даже не выживут. В рамках международного сообщества требуется, чтобы селекционеры и организации внимательно относились к этическому обращению с животными.